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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

沪政协委员：推动“上海智造”成为世界商品、全球产品******

　　尧金仁在“委员时间”环节发言　张昊　摄

　　中新网上海1月10日电(记者范宇斌)“上海是中国高端产业要素汇聚地、前沿产业创新引领地和先进制造水平示范地，全力推动‘上海智造’成为‘世界商品’‘全球产品’是‘国家所需、上海所向’，也是上海的天然使命和内生动力。”上海市政协委员、民盟上海市委常委、太平人寿保险有限公司上海自贸试验区分公司副总经理尧金仁10日如是说。

　　当日，中国人民政治协商会议上海市第十四届委员会第一次会议开幕首日，大会现场开启“委员时间”，邀请多位上海市政协委员围绕民生、教育、产业制造、文化、法治等热点话题通过网络直播进行分享和解答。

　　尧金仁是一位连续参加了三届政协履职工作的“老委员”。他说，放眼全球，具有世界影响力的国家或城市必有一种或几种响当当的“世界商品”“全球产品”。如瑞士的钟表和军刀、德国的奔驰和宝马、美国的制药、日本的电器、法国的香水等。“从某种意义上说，今天的‘上海智造’与历史上的茶叶、香料、咖啡、蔗糖等，本质上都是‘世界需求’下的‘全球产品’。”

　　在尧金仁看来，“上海智造”的历史底蕴、产业布局、综合优势叠加，是支撑上海建设“五个中心”和具有世界影响力的社会主义现代化国际大都市的重要底气和实力。他建议，上海应该在高端产业的引领、现代金融的配合、科技创新的支撑等方面继续发力，全力推动“上海智造”成为“世界商品”“全球产品”。

　　他谈及要以“世界影响力”的能级标准为标尺，全面提升“上海智造”能级。“比如，可以持续优化‘上海智造’空间格局，在上海主城区外、‘五个新城’、自贸区临港新片区建设各具特色的主导产业；全力打造集研发设计、智能制造、集成服务于一体的标志性世界级产业集群；持续强化深度融合，如汽车制造与研发、能源服务、进出口相融合，智能制造与金融、贸易、仓储、物流、航运建设相融合等。”

　　在现代金融的配合方面，尧金仁在调研中发现，现代金融在支持高科技企业方面取得了很大成就，但也面临比较突出的问题，“尤其对于硬科技来说，它的研发周期较长、风险较大，尤其需要中长期资本支持。”

　　他建议，可以发挥政府基金的引导作用，深化科创板改革发展，优先支持智能制造企业登陆资本市场，加快构建科创金融服务体系，打造与科创模式相匹配的优质创新资本中心，更好发挥注册制改革牵引作用等。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）